⒈光合菌群： EM菌液中的光合菌群（好氧性和厭氧性）屬于獨立營養微生物，它能利用土壤接受太陽熱能或以紫外線為能源，將土壤中的硫化氫和碳氫化合物中的氫分離出來，變有害物質為無害物質，并以植物根部的分泌物、有機物、有害氣體（硫化氫等）及二氧化碳、氮等為基質，合成糖類、氨基酸、維生素類、氮素化合物和生理活性物質等，是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。光合菌的代謝物質或者被植物直接吸收，或者成為其它微生物繁殖的養分，光合細菌如果能夠增殖，其它的有益微生物也會增殖。

⒉乳酸菌群： 乳酸菌（厭氧型） , 它以攝取光合細菌酵母菌產生的糖類等物質為基礎，產生乳酸。乳酸具有很強的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動，以及有機物的急劇腐/敗分解。乳酸菌能夠使常態下不易分解的木質素和纖維素等變得容易分解，并且消除未分解有機物產生的種種弊端，在有機物發酵分解上發揮突擊隊的重要作用，它將未腐熟的有機物質轉化成對動植物有效的養分。乳酸菌還能有效抑制連作障礙產生的致病菌增殖。

⒊酵母菌群： 酵母菌（好氧型）利用氨基酸、糖類及其它有機物質，通過發酵，產生出促進細胞分裂的活性化物質。酵母菌在 EM 集團軍中對于促進其它的有效微生物增殖所需要的基質（食物）的生產提供重要的營養保障。此外，酵母菌生產的單細胞蛋白是動物*的有效養分。

⒋革蘭氏陽性放線菌群（好氣性）。 它從光合細菌中獲取氨基酸、氮素等作為基質，產生出各種抗生物質、 維生素及酶，可以直接抑制病原菌。它提前獲取有害霉菌和細菌增殖所需要的基質，從而抑制它們的增殖，并創造出其它有益微生物增殖的生存環境。放線菌和光合細菌混合后的凈菌作用比放線菌單兵作戰的殺傷力要大得多。

它對難分解的物質，如木質素、纖維素、甲殼素等具有降解作用，并容易被動植物吸收，增強動植物對各種病害的抵抗力和免疫力。放線菌也會促進固氮菌和 VA 菌根菌增殖。

⒌發酵系的絲狀菌群（嫌氣性）。 以發酵酒精時使用的曲霉菌屬為主體，它能和其他微生物共存，尤其對土壤中酯的生成有良好效果。因為酒精生成力強，能防止蛆和其他害蟲的發生，并可以消除惡臭。

由上可見，各類微生物都各自發揮著重要作用，核心作用是光合細菌和嗜酸性乳桿菌為主導，其合成能力支撐著其他微生物的活動，同時也利用其他微生物產生的物質，形成共生共榮的關系，保證 EM菌液狀態穩定，功能齊全 ，發揮出集團軍作戰的強大能量。 EM菌液的主要功能是造就良性生態。只要施用恰當，它就會與所到之處的良性力量迅速結合，產生抗氧化物質，清除氧化物質，消除腐/敗，抑制病原菌，形成適于動植物生長的良好環境，同時，它還產生大量易為動植物吸收的有益物質，如氨基酸、有機酸、多醣類、各種維生素、各種生化酶、促生長因子、抗生素和抗病毒物質等，提高動植物的免疫功能，促進健康生長，從而在減輕勞動、降低成本、提高產量、改善品質，提前上市，使人們吃（用）上無污染的高質量產品的前提下，提高全社會的生產水平和生活質量，保護地球環境和人類美好的家園。